《Population structure of Y chromosome SNP haplogroups in the United States and forensic implications for constructing Y chromosome STR databases》一文里，有关于美国白人、黑人、印第安人、西班牙裔、亚裔等5个主要人群的Y染色体情况介绍。
一、取样
作为人种熔炉，美国包括了世界各地的人群祖源，本文中，共有38个人群（分城市）的共计2517个人被采样，从总体数量上还是非常可观的。
取样明细见下表：
二、总体分析
共有61个Y染色体SNP被分析，从2517个人的分析看。各种SNP出现的频率是从0.04%到37.8%，最低是D和N-P43，都各只有1个/2517个（0.04%）被检测出。最高的是R1b-M269，为37.8%，这个类型在爱尔兰、苏格兰、英国、法国、荷兰、西班牙等西欧和西南欧国家高发。第二高的类型为E-P1，这个类型是西非的主要类型，在全美国占比16.6%，在黑人中这个比例高达62.0%，说明美国黑人的主要来源地区是西非地区，与历史记载符合。
从5个人群Y父系PCA分布看，白人和西班牙比较接近，黑人由于普遍存在白人父系融入，也和两者较为接近，印第安和亚裔，则与这些人群距离较远。
三、各大种族的基因类型
白人EA (European–American)：
占据美国人口的绝大多数，父系Y上面，R1b-M269占比58.3%（西欧）、R1a-M17比例7.2%（东欧和印度）、I-P30比例11.7%（北欧）是较大的类型，其他值得说明的有，E-M78比例为2.9%（这个类型是地中海周边人群的，不是黑非洲的，拿破仑和希特勒都是这个类型），E-P1比例0.9%（这个类型是西非黑人的），Q-M3比例0.7%（印第安父系类型，相当于现代每142个美国白人中，有一个父系远祖实际是印第安人，印第安父系在以另一种隐性途径延续），另外有各种O-M175共计0.5%，这个是东亚父系对白人的影响，N-Tat仅占0.1%，说明来自俄罗斯和北欧东部的白人很少。
黑人AA（African–American）：
从黑人的父系看，其中主要由两部分构成，一个是来自黑非洲的远祖，包括E-P1（62.0%）、A-M91（1.4%）、B-M60（2.3%）、E-SRY（5.1%），另一部分来自白人的单方面融入，主要是R1b-M269（17.3%）、各种I-P30（5.3%），一些历史记录表明，男性白人奴隶主对女性黑人奴隶存在侵犯，并在黑人中留下了后代。
印第安人NA（Native-American，或称美洲原住民）
印第安各部落的数据差异很大，Q-P36（31.2%）、Q-M3（26.9%）、C2-P39（9.0%）是北美洲土著的类型，其中C2-P39只分布在北美洲西北部，Q-P36比Q-M3多也是相当的北美洲特点，南美则主要是Q-M3，大致相当于67%的父系仍然来自印第安人本族，这个比例远远比南美洲高。北美印第安人，其余的父系来自白人，比如R1b-M269（21.9%）等，历史记录中，白人在对印第安男性杀戮的同时，确实也有白人男性逃亡进入印第安部落并被接纳的事情，美国一些影视作品也有描述。
西班牙裔HA（Hispanic）
这个群体的父系是二元的：一部分是白人的R-M269（43.8%）、I（7.3%）、J（9.9%）、G-P15（4.4%）和其他，另一主要部分是Q-P36（3.8%）、Q-M3（7.9%）等印第安成分，西班牙裔没有C2-P36，因为拉美印第安没有这个类型，这个类型只分布在加拿大和美国西北部，西班牙裔的Q占比，是南美洲大部分印第安男性悲剧历史的缩影，殖民者入侵，杀掉男性留下女性，造成了南美混血人中只有不到10%（0-25%）的男性是印第安父系，其余父系来自白人，母系则全部是印第安女性的。
亚裔SA（Asian–American）
亚裔是父系祖源最单一的类型，传统上，亚裔仅仅指的是东亚后裔，不包括巴基斯坦、伊拉克、巴勒斯坦等南亚和西亚人，美国亚裔父系中各种O-M175占比高达88.7%，子类型中，最大的是O2-M122（54.8%），另外O1a-M119占比17.7%，O1b2占比8.1%，这是亚裔中日裔和韩裔的贡献。C2-M217占比4.8%，D占比1.6%，这些也是东亚特有的成分。
四、各大种群之间的混血
在美国5大种群中，各种群之间的融合是非常明显的。
下图中，白色为白人父系，黑色为黑人父系，深灰色为东亚父系，浅灰色为印第安父系，各大人群在不同城市（没有亚裔，亚裔只有两个城市取样）的父系分布，如下图：
白人处于最主体地位，历史上也最强势，白人对其他人群的父系成分都有一定的侵入和替代。以白人的R1b-M269为例，这个类型在白人中占比58.3%，在西班牙裔中占比43.8%，对黑人父系的影响是17.3%，对印第安人的影响是21.9%，对亚裔影响最小，是1.6%。
黑人历史上处于被白人压抑的地位，黑人最主流的父系为E-P1，占黑人的62.0%，但只占白人的0.9%（比对看，白人父系R1b占黑人的17.3%），占西班牙裔的5.8%，印第安人的1.3%，亚裔的1.6%。
西班牙裔和印第安人中的Q曾经是美洲的主人，在南美曾经占据100%的比例，在北美和C2-P39也共同构成100%，但现在仅占美国白人的0.7%、黑人的0.2%、亚裔的0百分之。在西班牙裔中有11.7%，印第安人中有58.1%。需要提示的是，美洲印第安的Q-M3和Q-P36和古代西伯利亚和古代匈奴的Q-L53、Q-L330共祖于17900-26200年前，和中国人的Q-M120共祖于28700-26200年前，印第安人和中国殷商没有很近的血缘关系。
亚裔是和其他族裔血缘最孤立的类型，亚裔中O的比例为88.7%，这个类型占白人的0.5%、西班牙裔的1.6%、黑人的0.3%，印第安裔为0的比例。这也说明了美国亚裔男性的尴尬，除了美国亚裔女性或引进东亚母国的女性外，他们很少能和其他族裔女性结婚生子。