目前我国的医疗分为城镇职工医疗保险，城乡居民医疗保险两种类型，灵活就业人员可以根据自己的需要和经济承受能力，在户籍地选择是缴纳职工医疗保险，还是缴纳城乡居民医疗保险。为了帮助大家更好地选择缴纳哪种医疗保险，下面我采用对比的方式和大家分享相关的知识信息。
第一，城镇职工医疗保险与城乡居民医疗保险的差别有哪些？
一是参保对象不同。职工医疗保险的参保对象为城镇在岗职工，包括了机关事业单位工作人员，企业职工。灵活就业人员可以个人身份参加城镇职工医疗保险；城乡居民医疗保险的主要参保对象为没有缴纳城镇职工医疗保险的其他城乡居民。
二是缴费的标准不同。城镇职工医疗保险是由用人单位和职工个人按比例缴纳，总的缴费比例为8%，其中单位缴费比例为6%，个人缴费比例为2%。用人单位是按照单位职工工资总额作为缴费基数，职工个人是按照本人实际工资作为缴费基数。灵活就业人员是按照统筹区上年度职工月平均工资作为缴费基数，缴费比例为8%，全部由灵活就业人员承担缴费金额；城乡居民医疗保险是按照年度进行缴费，采取个人缴费和国家补助相结合的方式。缴费标准是根据国家医保部门的规定执行，比如2021年的缴费标准为每人每年320元，政府补助580元。
三是享受的医疗待遇不同。城镇职工医疗保险要建立个人账户，个人缴费部分和单位缴费部分需要按照一定的比例返还到个人账户，个人账户资金按月返还到本人的社保卡。住院费用的报销比例比较高，在三级医院住院报销的比例可以达到80%以上；城乡居民医疗保险没有个人账户只有统筹账户，在三级医院住院的报销比例只有50%左右。
四是退休后的待遇不一样。缴纳城镇职工医疗保险，在办理退休时如果医疗保险的缴费年限达到国家规定的最低缴费年限，不再缴纳医疗保险，退休后终身享受医疗保险待遇；城乡居民医疗保险实行缴费一年享受一年的方式，缴费年限不累计计算，办理退休后还需要每年缴费才能享受医保待遇。
第二，怎样选择缴纳哪种医疗保险？
灵活就业人员缴纳医疗保险，只能在职工医疗保险和居民医疗保险中选择其中的一种进行缴纳，不能同时参保两种医疗保险。不知道怎么选择的朋友可以按照这三个标准进行选择。
一是缴纳职工养老保险，而且经济条件较好的灵活就业人员，建议选择缴纳职工医疗保险。这样既可以解决看病就医报销标准比较高的问题，同时在今后办理退休时，如果医疗保险达到规定的缴费年限，可以终身享受医保待遇，养老、就医的问题全部得到解决。
二是缴纳职工养老保险，但是经济条件不能支撑自己持续缴费的灵活就业人员，建议暂时缴纳城乡居民医疗保险。把有限的资金重点保证缴纳职工养老保险，这样既可以保障养老保险不会断缴，同时也可以解决基本的医疗保障问题。待今后办理退休时有钱了可以一次性补缴职工医疗保险，缴纳居民医疗保险的缴费年限可以折算为职工医疗保险的缴费年限。通过一次性补缴以后，退休后就可以终身享受医保待遇。
三是缴纳居民养老保险的灵活就业人员，建议缴纳居民医疗保险。如果缴纳居民养老保险去缴纳职工医疗保险，除了能够享受比较高的医保报销待遇以外，到领取居民养老保险待遇时，是无法享受医保退休待遇的，医保的退休待遇是和职工养老的退休待遇捆绑在一起的。
第三，灵活就业人员缴纳医疗保险怎么缴费？
灵活就业人员缴纳医疗保险，不管是缴纳职工医疗保险，还是缴纳城乡居民医疗保险，都必须要持本人的身份证原件到户籍所在地的街道和或是乡镇医保服务中心进行缴费账户登记，只有进行了缴费账户登记以后才能缴费。缴纳职工医疗保险的人员，可以选择按照月度缴费，也可以选择按照年度缴费，一般采用银行代扣代缴的方式，需要和银行签订代扣代缴协议，按月或是按年度在个人银行账户中扣款。
缴纳城乡居民医疗保险的人员，每年的9月1日到12月20日为集中缴费时间，可以选择在税务部门指定的银行自己在网上缴费、到当地税务部门的服务大厅进行缴费，也可以选择到银行大厅自己缴费。农村地区的还可以由村社干部代收代办。
综上所述，灵活就业人员缴纳医疗保险，可以根据自己缴纳养老保险的种类，个人的经济条件、年龄结构，自身健康状况等来选择缴纳职工医疗保险或是城乡居民医疗保险。首次缴费的还需要到户籍所在地的乡镇或是街道医保服务中心办理缴费登记，按照所缴纳医疗保险种类的规定，选择相应的缴费方式。